摘要
【我國科學家完成海灣紫扇貝基因組測序和組裝】25日,記者從青島農(nóng)業(yè)大學獲悉,該校海洋科學與工程學院王春德教授課題組與合作單位自主研發(fā)完成海灣扇貝兩個亞種的基因組測序和組裝。近日,相關(guān)研究成果在線發(fā)表在Nature旗下開源期刊Scientific Data上。(科技日報)
25日,記者從青島農(nóng)業(yè)大學獲悉,該校海洋科學與工程學院王春德教授課題組與合作單位自主研發(fā)完成海灣扇貝兩個亞種的基因組測序和組裝。近日,相關(guān)研究成果在線發(fā)表在Nature旗下開源期刊Scientific Data上。
此前,王春德課題組已完成紫扇貝基因組的測序和組裝。紫扇貝和海灣扇貝兩個亞種基因組的成功測序,為從分子水平解析海灣扇貝屬扇貝及其雜交后代的生長、抗逆性、育性和壽命等重要性狀的決定機制及分子育種,打下了基礎(chǔ)。
王春德表示,此次他們科研團隊在扇貝育種研究方面再次取得重要進展,成功完成海灣扇貝北部亞種和南部亞種基因組的測序和分析。
王春德介紹,海灣扇貝屬(Argopecten)是原產(chǎn)于美洲的雌雄同體型扇貝,大部分種類分布在北大西洋沿岸,其中海灣扇貝北部亞種和海灣扇貝南部亞種(又稱墨西哥灣扇貝)已由張福綏院士分別于1982年和1991年由美國引進我國,成為我國北方和南方海域主要扇貝養(yǎng)殖品種。紫扇貝是唯一分布于南太平洋沿岸的海灣扇貝屬種類,2007年由王春德教授課題組首次從秘魯引進我國。近年來,課題組通過將紫扇貝與海灣扇貝兩個亞種分別進行雜交,成功培育出一系列生長優(yōu)勢極其顯著的雜交扇貝新品種(品系),其中扇貝“渤海紅”“青農(nóng)2號”和“青農(nóng)金貝”已獲得國家水產(chǎn)新品種證書,成為我國北方的主要扇貝養(yǎng)殖品種,并在福建、廣西和廣東等南方海域養(yǎng)殖成功。
王春德課題組利用二代和三代測序相結(jié)合的方法測序并組裝了海灣扇貝兩個亞種的基因組。系統(tǒng)進化分析顯示,海灣扇貝兩個亞種先聚為一支,然后與蝦夷扇貝聚為一支,再與其他雙殼類聚為一支,然后再與腹足綱物種聚類。兩個海灣扇貝亞種的分歧時間為2640萬年前,與蝦夷扇貝的分歧時間為8590萬年前。
(文章來源:科技日報)